Es kostet zwar leider, aber es könnte etwas für dich sein:
Articy:Draft. Das Programm ist zum Planen von nicht-linearen Storys entworfen wurden. Da es auch für Open-World RPGs entwickelt wurde/wird, gibt es noch weitere Funktionen, die du allerdings wohl nicht brauchen wirst. Zum Testen gibt es eine (ich glaube) 2-wöchige gratis Demoversion mit vollem Funktionsumfang. Ich weiß nur leider nicht, ob du Geld dafür ausgeben möchtest (hast du nicht mit erwähnt).
Der Vorteil ist, dass du nicht nur deine Story schreiben kannst, sondern auch alle Charaktere, Gegenstände, jeweilige Eigenschaften (mit selbst erstellten Kategorien) und einiges mehr erstellen und in beliebigem Detailgrad ausarbeiten kannst. Zum Beispiel kannst du eine Ansicht für Kapitel erstellen, dann auf ein Kapitel klicken und die kapitelbezogenen Storystränge erstellen und dort dann sogar noch Dialoge schreiben. Du kannst das aber auch völlig anders aufbauen, je nachdem, wie du es brauchst.