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Aus meiner Sicht sind Branches für Zweige (wie der Name schon sagt) in der Entwicklung da:
- verschiedene Releases/Versionen
- verschiedene Feature-Sets

Wenn Ihr das nicht habt, braucht Ihr eigentlich keine Branches.

Ich nehme Branches für größere neue Features, damit der aktuelle "original" Code nicht angetastet wird, bis das Feature fertig ist und getestet wurde.

Du solltest dir auch bewusst sein, dass GitHub eine Webfrontend ist für Git, also die Frage ist eigentlich nicht über GitHub, sondern Git.

Es gibt verschiedene Arten um mit Git repositories umzugehen.
Um es einfach zu halten reicht es eigentlich völlig aus, wenn jeder lokal auf dem master (oder evtl. ein develop Branch) arbeitet. Die lokale Kopie ist ja eben bereits eine Kopie und kann ohne Probleme verändert werden. Um mit dem repo auf GitHub zu synchronisieren, empfiehlt sich zuerst git pull --rebase auszuführen. Damit wird werden dann die aktuellen Änderungen von GitHub geholt und deine Änderungen werden dann obendrauf gespielt. Dann kannst du einfach git push ausführen und deine lokale Kopie wird updated das Repo auf GitHub.
Gibt auch eine Möglichkeit wo einer alle Merges macht und die Entwicklung alle in Branches passieren.
Oder aber man kann es etwas "komplizierter" haben mit z.B. GitFlow.

Ich bin bei meinem aktuellen Projekt zwar der einzige der eincheckt, nutze aber trotzdem GitFlow.

Verschiedene Branches nutze ich alleine schon deswegen, weil man immer wieder in Situationen kommt, wo man das aktuelle Thema nicht weiterführen kann und man erstmal etwas anderes angeht. Da will man nicht unbedingt in den angefangenen Änderungen weitermachen.

Features nutze ich um einem Branch eine Überschrift zu geben. Wenn ich Änderungen habe, die zwar für das Feature nötig sind aber nicht zum Feature gehören, wird es ein neues Feature oder kommt direkt auf den develop Branch. Dann profitieren die anderen Features durch Rebase auch direkt davon. Das führt auch dazu, dass Features hauptsächlich Dinge hinzufügen, statt diese zu ändern. Das minimiert merge Konflikte deutlich.

P.S. Ich hoffe du hast in Unity die Asset Text Serialization eingestellt.

Ich nutze bei allen meinen Projekten das Branching-Model nach nvie. Das funktioniert sowohl bei Solo-Projekten hervorragend, als auch bei Teamprojekten.

Uebrigens koennte fuer euch Bitbucket das bessere Front-End sein. Dort koennt ihr im Gegenteil zu GitHub kostenfrei private Repositories erstellen.