@rewb0rn: du kannst auch einfach den pfad vom ordner ändern, das geht solange gut, als wenn du einfach alle ordner, die du syncen willst, sowieso schon im gleichen ordner hast.
anderenfalls kannst du auch hardlinks in den ordner rein setzen, das geht bei windows irgendwie über die commandline (bei linux gehts sowieso)). müsstest mal kurz googlen, das haben schon ein paar für dropbox gemacht.