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nativer Code, also Maschinencode, ist kein C++ oder Java (es sei denn, der Prozessor selbst kann direkt damit umgehen - sehr unwahrscheinlich)

eine App, die den Browser verwendet:
das wäre auch eine meiner Vorschläge gewesen, um es ganz billig zu lösen
allerdings hast du bereits geschrieben, dass es so zu langsam läuft (mit weelchem Gerät getestet?) und dass du nicht auf die Sensoren zugreifen kannst
bezüglich Sensoren:
Opera hat schon vor einiger Zeit (quasi für die Wii bzw. durch die Wii beeinflusst) "Widgets" in den Browser integriert, die HTML + CSS + Javascript Anwendungen sind
auf der Wii ausgeführt konnten diese auf die Daten der Wiimote zugreifen (Neigungssensor etc.)
entweder hast du genau diese API verwendet, weshalb es nur in Opera funktioniert
oder der Standardbrowser liefert tatsächlich nicht diese Funktionalität (kann ich mir ehrlich gesagt nur schwer vorstellen)

weitere Möglichkeiten wären:
eventuell kannst du auch einen in Java geschriebenen JavaScript interpreter verwenden, allerdings denke ich, dass das auch nicht ohne Aufwand funktionieren würde
es könnte sein, dass die Anwendung durch den Interpreter unnötig vergrößert wird...

und dann gibt es noch die von dir angesprochene Möglichkeit:
die Umwandlung deiner Anwendung in Java-Code oder Dalvik-Bytecode (?)
da kann ich dir leider keine Hinweise geben, weil ich mich damit bisher nicht beschäftigt habe

Mit Javascript ein perfomantes Spiel zu entwickeln, das möglichst auch noch auf allen Browsern flüssig läuft, ist schon eine extreme Herausforderung. Nicht umsonst benutzen die grösseren Browserspiele wie "Die Siedler" Flash.
Ich weiss natürlich jetzt nicht, wie komplex und aufwendig dein Spiel ist oder werden soll, oder ob es vielleicht möglich wäre, dass du dein Javascript-Code noch ein wenig optimierst.
Vielleicht hilft dir das aber weiter:
http://www.appmobi.com/?q=HTML5-game-dev-engine

Oder auch ne sehr schöne Sache, da es meiner Meinung die Zukunft der Browserspiele sein wird, ist das hier
http://www.ichemlabs.com/1375

Die meisten HTML5 Spiele die auch als App verfügbar sind, funktionieren einfach mithilfe der WebView-Komponente, die im Grunde die komplette App darstellt.
http://developer.android.com/reference/a…it/WebView.html
http://developer.apple.com/library/ios/#…IWebView_Class/

Wenn du das bereits probiert hast und keinen Zugriff auf die Sensoren hast, könntest du mit der nativen App die Sensoren per JavaScript als Objekt reinreichen und regelmäßig abfragen. Das macht das ganze aber sicher nicht schneller.

Edit: Evt. solltest du mal ausprobieren den WebChromeClient für die WebView zu nutzen: http://developer.android.com/reference/a…romeClient.html

Vielleicht solltest du dir mal GWT oder besser (im Falle von 2D Spielen) Google PlayN anschauen. Ansonsten würde ich das Spiel an deiner Stelle einfach weiter mit JavaScript entwickeln und hoffen, dass wenn du fertig bist, genug Geräte performant dein Spiel präsentieren können.

Ich hab mich neulich auch mal mit Browser-Cross-Plattform beschäftigt. In diesem Fall mit Browser-Cross-Plattform-3D-Spielen. Hier mein persönliches Ranking der Möglichkeiten:
Flash führt aus meiner Sicht. Ich bin mal gespannt, wie es mit Adobe AIR weitergeht, aber ich sehe da sehr positiv in die Zukunft. Ich habe bereits einige Tests gemacht und bin begeistert wie schnell und angenehm man mit Flash solche Spiele für mobile Endgeräte und den Browser erstellen kann. Allerdings benutze ich auch Flash CS6 und Flash Builder, da ich Adobe Creative Cloud Mitglied bin... Mit FlashDevelop und dem FlexSDK ist das ganze sicher etwas tüfteliger.